В 1961 году при Музыкально-педагогическом училище №3 города Иркутска на общественных началах была организована детская студия. Во главе ее встал известный в городе музыкант, руководитель оркестра народных инструментов И.Л.Булахов, а обучением детей по программе музыкальной школы в классах фортепиано, баяна и струнно-смычковых занялись преподаватели и студенты училища. В 1964 году студия получила статус городской музыкальной школы, а вскоре - и два деревянных домика во дворе, заросшем черемухой по ул. Профсоюзной.
В 1967 году директором школы стала работавшая в ней со дня основания М.В.Беседова - молодой талантливый хормейстер, выпускница Новосибирской консерватории, человек творчески одержимый, горячо влюбленный в свое дело. За короткий срок ею был сформирован коллектив молодых педагогов, заложены лучшие традиции школы: регулярная концертная деятельность учащихся и преподавателей, постоянное содружество с лучшими музыкантами и педагогами города (Т.Н. Колик, А.С.Сосинская, Л.Н.Семенцова, И.А.Соколов, Е.К.Папцова), здоровый дух соревнования, поддерживаемый организацией школьных конкурсов, фестивалей, открытых отчетных концертов в лучших концертных залах города, мощная поддержка авторитетного родительского комитета, благодаря которой эффективно решались хозяйственные проблемы и, наконец, решилась главная – школа в 1972 году получила роскошный старинный особняк на ул.Гоголя, где под руководством А.М. Пятковой начинается новая жизнь: идет реконструкция здания, увеличивается количество учащихся и педагогов.
В 1979 году директором школы стала С.А. Мощицкая. Талантливый и опытный руководитель, всецело преданный делу, она смогла организовать работу коллектива на более высоком уровне, обеспечив прекрасные условия для этой работы. Были приобретены концертные инструменты, открыты новые отделения: хоровое, театральное, отделение ударных и духовых инструментов, школа стала городским методическим центром.
ДМШ № 3 – одна из самых крупных в городе. Здесь обучаются более 450 учащихся, трудятся 59 педагогов, 32 из них - высшей категории, 10 Заслуженных работников культуры РФ, многие педагоги имеют правительственные награды.
Воспитанники школы - постоянные участники и победители городских и областных конкурсов, многие из них стали лауреатами региональных, конкурсов.
Многие выпускники школы стали профессиональными музыкантами. Иркутск и Иркутская область получили первоклассных специалистов: в училищах и школах, оркестрах Иркутска, Новосибирска, Красноярска и других городов России и даже за ее рубежами трудятся они.
ДМШ № 3 гордится своими творческими коллективами: хоровые коллективы (руководителя: Новиков М.Т., Тетерядченко Е.А., Боброва И.М., Никитина И.В.); оркестр народных инструментов (руководители: Усов Л.А., Орлов Н.П., Старицын В.М., Ващенко В.Г.) в разные годы становились лауреатами городских и областных, всероссийских и международных конкурсов.
Широко были известны в городе и малые ансамбли: квартет виолончелистов (Заслуженный работник культуры РФ Журавлева А.К.), квартет балалаечников (Светлаков В.Г.), лауреат Всероссийского конкурса квартет домр (Рябоконь З.П.), лауреат Международного конкурса секстет гитаристов (Арбатский В.Н.) и многие другие.
Театральное отделение (рук. Серикова Л.С.) - неоднократный лауреат фестивалей «Весенняя капель», «Театральная осень на Байкале» (закрыто в 2018 г.).
Стали традицией концерты учащихся с симфоническим и камерным оркестрами, струнным квартетом Иркутской областной филармонии.
В конце ноября 2013 года наша школа вошла в число лучших музыкальных школ России, став лауреатом конкурса "100 лучших школ России" и получив Диплом и Золотую медаль.
В мае 2014 года школа стала лауреатом конкурса «Новаторство в образовании» в номинации «Самый успешный проект – 2014» в области реализации программ художественного воспитания (проект – «Мотивация как условие успешного развития ребёнка в музыкальной школе в проекте «Концертные выступления учащихся ДМШ с профессиональными музыкантами»).
В октябре 2016 года на третьем Всероссийской фестивале инновационных продуктов школа стала лауреатом Всероссийского конкурса «Новаторства в образовании - 2016» в номинации «Самый успешный проект 2016» в области реализации программ художественного воспитания
В 2019 г. ДМШ № 3 – лауреат Всероссийского конкурса «500 лучших образовательных организаций страны – 2019»